ソニックは暖かい夜にくつろいでいたが、遠くに何かを目にした…

ドクター・エッグマンが異次元へのポータルを作り、その世界を乗っ取ろうと企んでいたのだ

ソニックがそこに着いたまさにその時、エッグマンとメタルソニックがポータルに入った！

ソニックは彼らを追ってポータルに入り、そこに見えたのは…まるでサウスアイランドのような場所だった？？

ソニックは様々なステージを駆け抜け、エッグマンの基地に到達し、彼の計画を再び阻止しなければならない！

しかし地平線では、別の何かが起こっている…

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